Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CGNL1Q0VF96 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CGNL1Q0VF96 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
CGNL1Q0VF96 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CGNL1Q0VF96 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms