Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX4Q06945 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX4Q06945 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX4Q06945 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms