Protein–RNA interactions for Protein: P62136

PPP1CA, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-alpha catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CAP62136 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP1CAP62136 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1CAP62136 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPP1CAP62136 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms