Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP5P51878 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP5P51878 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP5P51878 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP5P51878 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP5P51878 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP5P51878 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP5P51878 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP5P51878 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP5P51878 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP5P51878 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP5P51878 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP5P51878 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP5P51878 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP5P51878 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP5P51878 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP5P51878 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP5P51878 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP5P51878 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP5P51878 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP5P51878 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP5P51878 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP5P51878 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP5P51878 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP5P51878 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP5P51878 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP5P51878 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP5P51878 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP5P51878 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP5P51878 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP5P51878 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP5P51878 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP5P51878 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP5P51878 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP5P51878 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP5P51878 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CASP5P51878 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP5P51878 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP5P51878 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP5P51878 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP5P51878 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP5P51878 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP5P51878 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP5P51878 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP5P51878 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP5P51878 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP5P51878 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP5P51878 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP5P51878 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP5P51878 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CASP5P51878 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASP5P51878 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASP5P51878 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASP5P51878 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CASP5P51878 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP5P51878 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP5P51878 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP5P51878 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP5P51878 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP5P51878 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CASP5P51878 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP5P51878 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP5P51878 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP5P51878 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP5P51878 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP5P51878 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP5P51878 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP5P51878 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP5P51878 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP5P51878 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP5P51878 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP5P51878 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP5P51878 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP5P51878 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP5P51878 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP5P51878 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP5P51878 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP5P51878 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP5P51878 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP5P51878 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP5P51878 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP5P51878 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP5P51878 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP5P51878 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP5P51878 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP5P51878 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP5P51878 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP5P51878 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP5P51878 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP5P51878 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms