Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCR7P32248 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCR7P32248 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR7P32248 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR7P32248 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR7P32248 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR7P32248 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR7P32248 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR7P32248 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR7P32248 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR7P32248 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR7P32248 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCR7P32248 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR7P32248 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR7P32248 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR7P32248 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR7P32248 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR7P32248 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCR7P32248 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR7P32248 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR7P32248 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR7P32248 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR7P32248 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR7P32248 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR7P32248 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR7P32248 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR7P32248 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR7P32248 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCR7P32248 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR7P32248 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR7P32248 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR7P32248 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR7P32248 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCR7P32248 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCR7P32248 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCR7P32248 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR7P32248 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR7P32248 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR7P32248 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR7P32248 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR7P32248 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR7P32248 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR7P32248 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR7P32248 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR7P32248 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCR7P32248 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR7P32248 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR7P32248 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR7P32248 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR7P32248 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR7P32248 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR7P32248 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR7P32248 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR7P32248 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR7P32248 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR7P32248 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR7P32248 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR7P32248 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR7P32248 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCR7P32248 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR7P32248 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR7P32248 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR7P32248 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR7P32248 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR7P32248 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR7P32248 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR7P32248 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCR7P32248 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms