Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HOXC12P31275 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXC12P31275 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms