Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXA6P31267 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA6P31267 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms