Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CD58P19256 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD58P19256 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD58P19256 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD58P19256 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD58P19256 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD58P19256 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD58P19256 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD58P19256 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD58P19256 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CD58P19256 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD58P19256 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD58P19256 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD58P19256 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD58P19256 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD58P19256 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD58P19256 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD58P19256 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CD58P19256 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD58P19256 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD58P19256 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD58P19256 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD58P19256 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD58P19256 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD58P19256 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD58P19256 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD58P19256 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD58P19256 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD58P19256 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CD58P19256 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD58P19256 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD58P19256 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CD58P19256 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD58P19256 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD58P19256 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD58P19256 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD58P19256 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD58P19256 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD58P19256 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD58P19256 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD58P19256 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD58P19256 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD58P19256 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD58P19256 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD58P19256 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD58P19256 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD58P19256 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CD58P19256 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CD58P19256 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD58P19256 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD58P19256 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD58P19256 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD58P19256 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD58P19256 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD58P19256 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD58P19256 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD58P19256 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD58P19256 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD58P19256 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD58P19256 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD58P19256 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD58P19256 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD58P19256 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD58P19256 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD58P19256 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD58P19256 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD58P19256 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD58P19256 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD58P19256 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD58P19256 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD58P19256 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD58P19256 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD58P19256 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD58P19256 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CD58P19256 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CD58P19256 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD58P19256 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD58P19256 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD58P19256 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD58P19256 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD58P19256 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD58P19256 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD58P19256 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD58P19256 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD58P19256 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD58P19256 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD58P19256 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD58P19256 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD58P19256 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD58P19256 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD58P19256 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD58P19256 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD58P19256 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD58P19256 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD58P19256 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CD58P19256 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD58P19256 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD58P19256 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD58P19256 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD58P19256 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms