Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CREB1P16220 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB1P16220 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB1P16220 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB1P16220 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB1P16220 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB1P16220 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB1P16220 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB1P16220 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CREB1P16220 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CREB1P16220 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB1P16220 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB1P16220 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB1P16220 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB1P16220 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB1P16220 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB1P16220 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB1P16220 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB1P16220 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB1P16220 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CREB1P16220 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CREB1P16220 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB1P16220 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB1P16220 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB1P16220 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB1P16220 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB1P16220 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB1P16220 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB1P16220 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CREB1P16220 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB1P16220 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB1P16220 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB1P16220 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB1P16220 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB1P16220 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB1P16220 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB1P16220 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB1P16220 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CREB1P16220 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB1P16220 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB1P16220 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB1P16220 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB1P16220 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB1P16220 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB1P16220 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB1P16220 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB1P16220 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB1P16220 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB1P16220 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB1P16220 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB1P16220 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB1P16220 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB1P16220 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB1P16220 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB1P16220 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB1P16220 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB1P16220 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB1P16220 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB1P16220 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB1P16220 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB1P16220 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB1P16220 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB1P16220 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB1P16220 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB1P16220 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB1P16220 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB1P16220 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB1P16220 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB1P16220 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB1P16220 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB1P16220 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB1P16220 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB1P16220 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB1P16220 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB1P16220 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB1P16220 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB1P16220 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB1P16220 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB1P16220 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CREB1P16220 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CREB1P16220 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CREB1P16220 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CREB1P16220 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CREB1P16220 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB1P16220 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms