Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFD2P13995 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MTHFD2P13995 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MTHFD2P13995 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms