Protein–RNA interactions for Protein: P09669

COX6C, Cytochrome c oxidase subunit 6C, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6CP09669 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX6CP09669 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6CP09669 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6CP09669 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6CP09669 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6CP09669 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6CP09669 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6CP09669 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6CP09669 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6CP09669 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6CP09669 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6CP09669 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6CP09669 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX6CP09669 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX6CP09669 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6CP09669 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6CP09669 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6CP09669 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6CP09669 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6CP09669 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6CP09669 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6CP09669 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6CP09669 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6CP09669 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6CP09669 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6CP09669 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6CP09669 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX6CP09669 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
COX6CP09669 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6CP09669 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6CP09669 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6CP09669 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6CP09669 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6CP09669 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6CP09669 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6CP09669 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6CP09669 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6CP09669 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6CP09669 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6CP09669 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6CP09669 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6CP09669 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COX6CP09669 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6CP09669 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6CP09669 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6CP09669 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6CP09669 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6CP09669 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6CP09669 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6CP09669 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6CP09669 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COX6CP09669 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms