Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED1O96006 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED1O96006 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ZBED1O96006 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
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