Protein–RNA interactions for Protein: O95502

NPTXR, Neuronal pentraxin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXRO95502 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPTXRO95502 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPTXRO95502 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NPTXRO95502 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPTXRO95502 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPTXRO95502 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPTXRO95502 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPTXRO95502 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPTXRO95502 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPTXRO95502 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTXRO95502 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTXRO95502 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NPTXRO95502 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms