Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGSF3O75054 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF3O75054 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF3O75054 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGSF3O75054 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF3O75054 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF3O75054 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGSF3O75054 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF3O75054 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF3O75054 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF3O75054 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF3O75054 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IGSF3O75054 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF3O75054 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF3O75054 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF3O75054 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF3O75054 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF3O75054 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF3O75054 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF3O75054 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF3O75054 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGSF3O75054 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF3O75054 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF3O75054 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF3O75054 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF3O75054 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF3O75054 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF3O75054 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF3O75054 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF3O75054 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF3O75054 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IGSF3O75054 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IGSF3O75054 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGSF3O75054 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF3O75054 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF3O75054 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF3O75054 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF3O75054 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF3O75054 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF3O75054 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF3O75054 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF3O75054 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF3O75054 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
IGSF3O75054 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF3O75054 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF3O75054 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF3O75054 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF3O75054 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF3O75054 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF3O75054 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IGSF3O75054 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGSF3O75054 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IGSF3O75054 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IGSF3O75054 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
IGSF3O75054 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGSF3O75054 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.2 ms