Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUX1O43812 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUX1O43812 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUX1O43812 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUX1O43812 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUX1O43812 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUX1O43812 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUX1O43812 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUX1O43812 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUX1O43812 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUX1O43812 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUX1O43812 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUX1O43812 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUX1O43812 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUX1O43812 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUX1O43812 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUX1O43812 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUX1O43812 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUX1O43812 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUX1O43812 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUX1O43812 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUX1O43812 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUX1O43812 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUX1O43812 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
DUX1O43812 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DUX1O43812 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUX1O43812 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUX1O43812 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUX1O43812 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUX1O43812 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUX1O43812 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUX1O43812 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUX1O43812 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DUX1O43812 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUX1O43812 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUX1O43812 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUX1O43812 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUX1O43812 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DUX1O43812 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUX1O43812 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DUX1O43812 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUX1O43812 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DUX1O43812 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUX1O43812 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUX1O43812 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DUX1O43812 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DUX1O43812 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DUX1O43812 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DUX1O43812 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DUX1O43812 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DUX1O43812 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DUX1O43812 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUX1O43812 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUX1O43812 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUX1O43812 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUX1O43812 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUX1O43812 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUX1O43812 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUX1O43812 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DUX1O43812 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUX1O43812 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUX1O43812 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUX1O43812 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUX1O43812 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUX1O43812 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DUX1O43812 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DUX1O43812 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DUX1O43812 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DUX1O43812 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DUX1O43812 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUX1O43812 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUX1O43812 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUX1O43812 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUX1O43812 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DUX1O43812 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUX1O43812 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DUX1O43812 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX1O43812 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX1O43812 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX1O43812 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX1O43812 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX1O43812 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX1O43812 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX1O43812 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX1O43812 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DUX1O43812 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms