Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms