Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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TRBV5-3A0A0A0MS03 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
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TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRBV5-3A0A0A0MS03 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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