Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUV0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUV0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A087WUV0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A0A087WUV0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087WUV0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087WUV0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
A0A087WUV0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087WUV0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087WUV0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087WUV0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087WUV0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A0A087WUV0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms