Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
A3GALT2U3KPV4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
A3GALT2U3KPV4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
A3GALT2U3KPV4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms