Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHAC2Q9Y5I4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHAC2Q9Y5I4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHAC2Q9Y5I4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms