Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KCTD3Q9Y597 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCTD3Q9Y597 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCTD3Q9Y597 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms