Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TRPC6Q9Y210 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRPC6Q9Y210 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRPC6Q9Y210 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms