Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYO6Q9UM54 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MYO6Q9UM54 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms