Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CDK12Q9NYV4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CDK12Q9NYV4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CDK12Q9NYV4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms