Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SMC4Q9NTJ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMC4Q9NTJ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SMC4Q9NTJ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms