Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PREBQ9HCU5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PREBQ9HCU5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms