Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NSD3Q9BZ95 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NSD3Q9BZ95 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
NSD3Q9BZ95 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NSD3Q9BZ95 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NSD3Q9BZ95 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NSD3Q9BZ95 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NSD3Q9BZ95 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms