Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NMD3Q96D46 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.9 ms