Protein–RNA interactions for Protein: Q92499

DDX1, ATP-dependent RNA helicase DDX1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX1Q92499 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DDX1Q92499 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DDX1Q92499 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DDX1Q92499 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms