Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CSRNP3Q8WYN3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CSRNP3Q8WYN3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CSRNP3Q8WYN3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
CSRNP3Q8WYN3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CSRNP3Q8WYN3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CSRNP3Q8WYN3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CSRNP3Q8WYN3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
CSRNP3Q8WYN3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CSRNP3Q8WYN3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
CSRNP3Q8WYN3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CSRNP3Q8WYN3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC37.74■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.4 ms