Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ARHGEF28Q8N1W1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
ARHGEF28Q8N1W1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
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