Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PARP9Q8IXQ6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PARP9Q8IXQ6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms