Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX30

SCUBE3, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE3Q8IX30 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SCUBE3Q8IX30 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCUBE3Q8IX30 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCUBE3Q8IX30 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms