Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SKAP1Q86WV1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SKAP1Q86WV1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SKAP1Q86WV1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms