Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NFXL1Q6ZNB6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
NFXL1Q6ZNB6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NFXL1Q6ZNB6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms