Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIW4

FIGNL1, Fidgetin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIGNL1Q6PIW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FIGNL1Q6PIW4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FIGNL1Q6PIW4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms