Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZKSCAN2Q63HK3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ZKSCAN2Q63HK3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZKSCAN2Q63HK3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms