Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RSBN1Q5VWQ0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RSBN1Q5VWQ0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms