Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LINC01545Q5VT33 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LINC01545Q5VT33 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms