Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAPPA-AS1Q5QFB9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms