Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRRT3Q5FWE3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRRT3Q5FWE3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRRT3Q5FWE3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms