Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
COL19A1Q14993 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COL19A1Q14993 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COL19A1Q14993 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms