Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SCN5AQ14524 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN5AQ14524 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN5AQ14524 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
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