Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 PSME4-201ENST00000389993 6581 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.581e-6■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.291e-9■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 ASL-202ENST00000362000 928 ntTSL 212.72□□□□□ -0.371e-9■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.41e-9■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 ASL-207ENST00000487982 1007 ntTSL 212.06□□□□□ -0.481e-9■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.511e-9■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.651e-9■■□□□ 12.6
SRSF9Q13242 PLXNB1-203ENST00000449094 3863 ntTSL 29.72□□□□□ -0.854e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 415.31■□□□□ 0.044e-9■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.34e-9■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.422e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.534e-9■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 SYNCRIP-201ENST00000355238 6449 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.622e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.672e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.74e-9■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 ZC3H18-212ENST00000569435 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 510.36□□□□□ -0.752e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 510.31□□□□□ -0.764e-9■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.852e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 PAQR8-201ENST00000360726 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -14e-9■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 SYNCRIP-203ENST00000444272 610 ntTSL 38.79□□□□□ -12e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 PAQR8-203ENST00000512121 582 ntTSL 38.15□□□□□ -1.14e-9■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.72e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 GUSBP11-201ENST00000422506 2055 ntTSL 214.66□□□□□ -0.069e-7■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 GUSBP11-205ENST00000452737 1662 ntTSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.29e-7■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.349e-7■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 GUSBP11-203ENST00000445682 3350 ntTSL 211.19□□□□□ -0.629e-7■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 GUSBP11-204ENST00000451837 3234 ntTSL 1 (best)10.92□□□□□ -0.669e-7■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC10.77□□□□□ -0.699e-7■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 COL27A1-207ENST00000494090 5329 ntTSL 1 (best)16.45■□□□□ 0.227e-7■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.097e-7■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 ANKRD11-206ENST00000562275 2762 ntTSL 510.31□□□□□ -0.763e-7■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.482e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.142e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 HLF-204ENST00000572002 1251 ntTSL 37.8□□□□□ -1.162e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 HLF-203ENST00000570962 1310 ntTSL 27.04□□□□□ -1.282e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 HLF-207ENST00000573422 493 ntTSL 47□□□□□ -1.292e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 HLF-208ENST00000573945 2977 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.292e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.422e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 HLF-206ENST00000573020 414 ntTSL 46.03□□□□□ -1.442e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 HLF-211ENST00000575868 558 ntTSL 43.28□□□□□ -1.882e-6■■□□□ 12.5
SRSF9Q13242 TCF25-207ENST00000562256 1879 ntTSL 1 (best)13.65□□□□□ -0.225e-8■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 TCF25-224ENST00000570116 1947 ntTSL 512.35□□□□□ -0.435e-8■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.445e-8■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.455e-8■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 TCF25-226ENST00000640279 2688 ntTSL 511.97□□□□□ -0.495e-8■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 TCF25-210ENST00000563484 468 ntTSL 26.78□□□□□ -1.325e-8■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 CYP2W1-203ENST00000415893 890 ntTSL 311.2□□□□□ -0.623e-8■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.3□□□□□ -1.724e-6■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-236ENST00000584991 1862 ntTSL 510.93□□□□□ -0.662e-12■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-237ENST00000585163 2519 ntTSL 1 (best)10.56□□□□□ -0.722e-12■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-218ENST00000580391 1957 ntTSL 510.1□□□□□ -0.792e-12■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-12■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-232ENST00000584168 2684 ntTSL 59.4□□□□□ -0.92e-12■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-219ENST00000580670 1768 ntTSL 59.35□□□□□ -0.912e-12■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.922e-12■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC9.11□□□□□ -0.952e-12■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-217ENST00000580287 2609 ntTSL 1 (best)9.03□□□□□ -0.962e-12■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-231ENST00000584063 2759 ntTSL 1 (best)8.73□□□□□ -1.012e-12■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 CDK5RAP3-212ENST00000579175 867 ntTSL 37.81□□□□□ -1.162e-12■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 PIDD1-209ENST00000531286 1937 ntTSL 213.45□□□□□ -0.269e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.339e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 GCFC2-204ENST00000442309 642 ntTSL 512.87□□□□□ -0.359e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.439e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.459e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.489e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.489e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 ZXDC-204ENST00000515545 2635 ntTSL 1 (best)11.96□□□□□ -0.59e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 PIDD1-205ENST00000527357 4496 ntTSL 211.77□□□□□ -0.539e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.69e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.62e-9■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.659e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 PIDD1-203ENST00000524486 3917 ntTSL 210.48□□□□□ -0.739e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 PIDD1-204ENST00000525028 3175 ntTSL 1 (best)10.37□□□□□ -0.759e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.779e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 PIDD1-206ENST00000527812 481 ntTSL 310.11□□□□□ -0.799e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 PIDD1-210ENST00000534525 3994 ntTSL 210.09□□□□□ -0.799e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 TRIM65-203ENST00000540812 385 ntTSL 210.06□□□□□ -0.89e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 PACSIN2-210ENST00000453643 818 ntTSL 59.86□□□□□ -0.832e-9■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 TIMMDC1-205ENST00000486418 551 ntTSL 39.37□□□□□ -0.919e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 SLC26A6-208ENST00000421649 910 ntTSL 39.3□□□□□ -0.929e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 SSTR5-AS1-202ENST00000566499 479 ntTSL 48.91□□□□□ -0.989e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 TIMMDC1-208ENST00000494664 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -19e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 AC092279.1-201ENST00000594934 1864 ntTSL 28.74□□□□□ -1.019e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 AC092279.1-202ENST00000597683 1966 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.139e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 SLC26A6-222ENST00000496469 1034 ntTSL 57.87□□□□□ -1.159e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 TIMMDC1-201ENST00000264244 1271 ntTSL 1 (best)7.71□□□□□ -1.189e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.189e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 TIMMDC1-206ENST00000492164 725 ntTSL 37.6□□□□□ -1.199e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 PACSIN2-208ENST00000445706 511 ntTSL 57.26□□□□□ -1.252e-9■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 TIMMDC1-203ENST00000466984 605 ntTSL 57.06□□□□□ -1.289e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 TIMMDC1-202ENST00000463927 670 ntTSL 56.1□□□□□ -1.439e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.549e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 TIMMDC1-209ENST00000498399 684 ntTSL 23.48□□□□□ -1.859e-7■■□□□ 12.4
SRSF9Q13242 MAGI1-205ENST00000464060 2247 ntTSL 1 (best)17.11■□□□□ 0.332e-9■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.042e-9■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.192e-9■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.282e-9■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.462e-9■■□□□ 12.3
SRSF9Q13242 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.96e-11■■□□□ 12.3
Retrieved 100 of 3,885 protein–RNA pairs in 284.5 ms