RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492164.5

TIMMDC1-206, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TIMMDC1, Length 725 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-206ENST00000492164 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.99■■■□□ 2.55
TIMMDC1-206ENST00000492164 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.92■■■□□ 2.06
TIMMDC1-206ENST00000492164 ABCC9O60706 1549 aa27.91■■■□□ 2.06
TIMMDC1-206ENST00000492164 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.55■■□□□ 1.84
TIMMDC1-206ENST00000492164 NACADO15069 1562 aa26.33■■□□□ 1.81
TIMMDC1-206ENST00000492164 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.16■■□□□ 1.78
TIMMDC1-206ENST00000492164 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.13■■□□□ 1.77
TIMMDC1-206ENST00000492164 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.08■■□□□ 1.76
TIMMDC1-206ENST00000492164 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.93■■□□□ 1.74
TIMMDC1-206ENST00000492164 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
TIMMDC1-206ENST00000492164 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.8■■□□□ 1.72
TIMMDC1-206ENST00000492164 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
TIMMDC1-206ENST00000492164 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.58■■□□□ 1.69
TIMMDC1-206ENST00000492164 SCRIBQ14160 1630 aa25.44■■□□□ 1.66
TIMMDC1-206ENST00000492164 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.4■■□□□ 1.66
TIMMDC1-206ENST00000492164 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.24■■□□□ 1.63
TIMMDC1-206ENST00000492164 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TIMMDC1-206ENST00000492164 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.13■■□□□ 1.61
TIMMDC1-206ENST00000492164 NCAPD3P42695 1498 aa24.27■■□□□ 1.48
TIMMDC1-206ENST00000492164 SMARCA4P51532 1647 aa24.24■■□□□ 1.47
TIMMDC1-206ENST00000492164 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.21■■□□□ 1.47
TIMMDC1-206ENST00000492164 SMARCA2P51531 1590 aa24.17■■□□□ 1.46
TIMMDC1-206ENST00000492164 HMGXB3Q12766 1538 aa24.15■■□□□ 1.46
TIMMDC1-206ENST00000492164 ERCC6Q03468 1493 aa24.09■■□□□ 1.45
TIMMDC1-206ENST00000492164 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
TIMMDC1-206ENST00000492164 CUX2O14529 1486 aa24.05■■□□□ 1.44
TIMMDC1-206ENST00000492164 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.03■■□□□ 1.44
TIMMDC1-206ENST00000492164 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
TIMMDC1-206ENST00000492164 NESP48681 1621 aa23.97■■□□□ 1.43
TIMMDC1-206ENST00000492164 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.97■■□□□ 1.43
TIMMDC1-206ENST00000492164 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.91■■□□□ 1.42
TIMMDC1-206ENST00000492164 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.79■■□□□ 1.4
TIMMDC1-206ENST00000492164 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
TIMMDC1-206ENST00000492164 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.74■■□□□ 1.39
TIMMDC1-206ENST00000492164 WIZO95785 1651 aa23.66■■□□□ 1.38
TIMMDC1-206ENST00000492164 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.59■■□□□ 1.37
TIMMDC1-206ENST00000492164 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.52■■□□□ 1.36
TIMMDC1-206ENST00000492164 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.44■■□□□ 1.34
TIMMDC1-206ENST00000492164 WDR62O43379 1518 aa23.41■■□□□ 1.34
TIMMDC1-206ENST00000492164 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
TIMMDC1-206ENST00000492164 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.35■■□□□ 1.33
TIMMDC1-206ENST00000492164 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
TIMMDC1-206ENST00000492164 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.3■■□□□ 1.32
TIMMDC1-206ENST00000492164 CFTRP13569 1480 aa23.27■■□□□ 1.32
TIMMDC1-206ENST00000492164 PRDM2Q13029 1718 aa23.19■■□□□ 1.3
TIMMDC1-206ENST00000492164 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
TIMMDC1-206ENST00000492164 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.02■■□□□ 1.28
TIMMDC1-206ENST00000492164 TRIM41Q8WV44 630 aa23.01■■□□□ 1.27
TIMMDC1-206ENST00000492164 OSCARQ8IYS5 282 aa22.88■■□□□ 1.25
TIMMDC1-206ENST00000492164 TOPBP1Q92547 1522 aa22.87■■□□□ 1.25
TIMMDC1-206ENST00000492164 IFT140Q96RY7 1462 aa22.85■■□□□ 1.25
TIMMDC1-206ENST00000492164 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TIMMDC1-206ENST00000492164 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.8■■□□□ 1.24
TIMMDC1-206ENST00000492164 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
TIMMDC1-206ENST00000492164 ABCC8Q09428 1581 aa22.78■■□□□ 1.24
TIMMDC1-206ENST00000492164 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1-206ENST00000492164 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1-206ENST00000492164 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.72■■□□□ 1.23
TIMMDC1-206ENST00000492164 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
TIMMDC1-206ENST00000492164 CHD1O14646 1710 aa22.66■■□□□ 1.22
TIMMDC1-206ENST00000492164 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TIMMDC1-206ENST00000492164 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.61■■□□□ 1.215e-6■■■■□ 23.9
TIMMDC1-206ENST00000492164 ARHGEF11O15085 1522 aa22.61■■□□□ 1.21
TIMMDC1-206ENST00000492164 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.54■■□□□ 1.2
TIMMDC1-206ENST00000492164 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.49■■□□□ 1.19
TIMMDC1-206ENST00000492164 SOGA1O94964 1423 aa22.48■■□□□ 1.19
TIMMDC1-206ENST00000492164 CUX1P39880 1505 aa22.47■■□□□ 1.19
TIMMDC1-206ENST00000492164 FBLN2P98095 1184 aa22.45■■□□□ 1.18
TIMMDC1-206ENST00000492164 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TIMMDC1-206ENST00000492164 WDR97A6NE52 1622 aa22.45■■□□□ 1.18
TIMMDC1-206ENST00000492164 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.41■■□□□ 1.18
TIMMDC1-206ENST00000492164 ARAP1Q96P48 1450 aa22.38■■□□□ 1.17
TIMMDC1-206ENST00000492164 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.37■■□□□ 1.17
TIMMDC1-206ENST00000492164 PBRM1Q86U86 1689 aa22.35■■□□□ 1.17
TIMMDC1-206ENST00000492164 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TIMMDC1-206ENST00000492164 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.32■■□□□ 1.16
TIMMDC1-206ENST00000492164 GRIN2BQ13224 1484 aa22.32■■□□□ 1.16
TIMMDC1-206ENST00000492164 SYNJ1O43426 1573 aa22.3■■□□□ 1.16
TIMMDC1-206ENST00000492164 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TIMMDC1-206ENST00000492164 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
TIMMDC1-206ENST00000492164 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
TIMMDC1-206ENST00000492164 SYNJ2O15056 1496 aa22.25■■□□□ 1.15
TIMMDC1-206ENST00000492164 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.24■■□□□ 1.15
TIMMDC1-206ENST00000492164 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.23■■□□□ 1.15
TIMMDC1-206ENST00000492164 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.21■■□□□ 1.15
TIMMDC1-206ENST00000492164 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
TIMMDC1-206ENST00000492164 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.13■■□□□ 1.13
TIMMDC1-206ENST00000492164 TOP2BQ02880 1626 aa22.1■■□□□ 1.13
TIMMDC1-206ENST00000492164 ADAMTS12P58397 1594 aa22.08■■□□□ 1.13
TIMMDC1-206ENST00000492164 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
TIMMDC1-206ENST00000492164 GRIN2AQ12879 1464 aa22.05■■□□□ 1.12
TIMMDC1-206ENST00000492164 CEP170Q5SW79 1584 aa22■■□□□ 1.11
TIMMDC1-206ENST00000492164 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.99■■□□□ 1.11
TIMMDC1-206ENST00000492164 NUP160Q12769 1436 aa21.96■■□□□ 1.11
TIMMDC1-206ENST00000492164 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1-206ENST00000492164 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.94■■□□□ 1.1
TIMMDC1-206ENST00000492164 SHROOM2Q13796 1616 aa21.92■■□□□ 1.1
TIMMDC1-206ENST00000492164 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.78■■□□□ 1.08
TIMMDC1-206ENST00000492164 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
TIMMDC1-206ENST00000492164 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.71■■□□□ 1.07
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