RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486418.5

TIMMDC1-205, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TIMMDC1, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-205ENST00000486418 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37■■■■□ 3.51
TIMMDC1-205ENST00000486418 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33■■■□□ 2.87
TIMMDC1-205ENST00000486418 ABCC9O60706 1549 aa32.51■■■□□ 2.79
TIMMDC1-205ENST00000486418 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.19■■■□□ 2.58
TIMMDC1-205ENST00000486418 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.16■■■□□ 2.58
TIMMDC1-205ENST00000486418 NACADO15069 1562 aa31.09■■■□□ 2.57
TIMMDC1-205ENST00000486418 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.79■■■□□ 2.52
TIMMDC1-205ENST00000486418 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
TIMMDC1-205ENST00000486418 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.58■■■□□ 2.49
TIMMDC1-205ENST00000486418 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.53■■■□□ 2.48
TIMMDC1-205ENST00000486418 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.38■■■□□ 2.45
TIMMDC1-205ENST00000486418 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.21■■■□□ 2.43
TIMMDC1-205ENST00000486418 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.08■■■□□ 2.41
TIMMDC1-205ENST00000486418 SCRIBQ14160 1630 aa30.07■■■□□ 2.4
TIMMDC1-205ENST00000486418 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.84■■■□□ 2.37
TIMMDC1-205ENST00000486418 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
TIMMDC1-205ENST00000486418 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.41■■■□□ 2.3
TIMMDC1-205ENST00000486418 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.23■■■□□ 2.27
TIMMDC1-205ENST00000486418 SMARCA4P51532 1647 aa28.75■■■□□ 2.19
TIMMDC1-205ENST00000486418 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
TIMMDC1-205ENST00000486418 NCAPD3P42695 1498 aa28.68■■■□□ 2.18
TIMMDC1-205ENST00000486418 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.65■■■□□ 2.18
TIMMDC1-205ENST00000486418 SMARCA2P51531 1590 aa28.62■■■□□ 2.17
TIMMDC1-205ENST00000486418 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.5■■■□□ 2.15
TIMMDC1-205ENST00000486418 HMGXB3Q12766 1538 aa28.48■■■□□ 2.15
TIMMDC1-205ENST00000486418 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.45■■■□□ 2.14
TIMMDC1-205ENST00000486418 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
TIMMDC1-205ENST00000486418 WIZO95785 1651 aa28.23■■■□□ 2.11
TIMMDC1-205ENST00000486418 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TIMMDC1-205ENST00000486418 NESP48681 1621 aa28.06■■■□□ 2.08
TIMMDC1-205ENST00000486418 ERCC6Q03468 1493 aa28.05■■■□□ 2.08
TIMMDC1-205ENST00000486418 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.96■■■□□ 2.07
TIMMDC1-205ENST00000486418 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
TIMMDC1-205ENST00000486418 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.86■■■□□ 2.05
TIMMDC1-205ENST00000486418 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.81■■■□□ 2.04
TIMMDC1-205ENST00000486418 CUX2O14529 1486 aa27.8■■■□□ 2.04
TIMMDC1-205ENST00000486418 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.75■■■□□ 2.03
TIMMDC1-205ENST00000486418 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
TIMMDC1-205ENST00000486418 CFTRP13569 1480 aa27.61■■■□□ 2.01
TIMMDC1-205ENST00000486418 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.57■■■□□ 2
TIMMDC1-205ENST00000486418 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.51■■■□□ 2
TIMMDC1-205ENST00000486418 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.49■■□□□ 1.99
TIMMDC1-205ENST00000486418 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.49■■□□□ 1.99
TIMMDC1-205ENST00000486418 PRDM2Q13029 1718 aa27.45■■□□□ 1.99
TIMMDC1-205ENST00000486418 WDR62O43379 1518 aa27.39■■□□□ 1.98
TIMMDC1-205ENST00000486418 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
TIMMDC1-205ENST00000486418 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.3■■□□□ 1.96
TIMMDC1-205ENST00000486418 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
TIMMDC1-205ENST00000486418 ABCC8Q09428 1581 aa27.08■■□□□ 1.93
TIMMDC1-205ENST00000486418 TOPBP1Q92547 1522 aa27.05■■□□□ 1.92
TIMMDC1-205ENST00000486418 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.99■■□□□ 1.91
TIMMDC1-205ENST00000486418 IFT140Q96RY7 1462 aa26.93■■□□□ 1.9
TIMMDC1-205ENST00000486418 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
TIMMDC1-205ENST00000486418 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
TIMMDC1-205ENST00000486418 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
TIMMDC1-205ENST00000486418 CUX1P39880 1505 aa26.75■■□□□ 1.87
TIMMDC1-205ENST00000486418 SOGA1O94964 1423 aa26.73■■□□□ 1.87
TIMMDC1-205ENST00000486418 OSCARQ8IYS5 282 aa26.72■■□□□ 1.87
TIMMDC1-205ENST00000486418 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.7■■□□□ 1.87
TIMMDC1-205ENST00000486418 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.69■■□□□ 1.86
TIMMDC1-205ENST00000486418 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
TIMMDC1-205ENST00000486418 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.68■■□□□ 1.865e-6■■■■□ 23.9
TIMMDC1-205ENST00000486418 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
TIMMDC1-205ENST00000486418 WDR97A6NE52 1622 aa26.54■■□□□ 1.84
TIMMDC1-205ENST00000486418 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
TIMMDC1-205ENST00000486418 TOP2BQ02880 1626 aa26.48■■□□□ 1.83
TIMMDC1-205ENST00000486418 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.48■■□□□ 1.83
TIMMDC1-205ENST00000486418 FBLN2P98095 1184 aa26.48■■□□□ 1.83
TIMMDC1-205ENST00000486418 CHD1O14646 1710 aa26.47■■□□□ 1.83
TIMMDC1-205ENST00000486418 SYNJ1O43426 1573 aa26.43■■□□□ 1.82
TIMMDC1-205ENST00000486418 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.43■■□□□ 1.82
TIMMDC1-205ENST00000486418 GRIN2BQ13224 1484 aa26.42■■□□□ 1.82
TIMMDC1-205ENST00000486418 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.4■■□□□ 1.82
TIMMDC1-205ENST00000486418 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.38■■□□□ 1.81
TIMMDC1-205ENST00000486418 PBRM1Q86U86 1689 aa26.37■■□□□ 1.81
TIMMDC1-205ENST00000486418 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
TIMMDC1-205ENST00000486418 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
TIMMDC1-205ENST00000486418 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.32■■□□□ 1.8
TIMMDC1-205ENST00000486418 TRIM41Q8WV44 630 aa26.31■■□□□ 1.8
TIMMDC1-205ENST00000486418 SYNJ2O15056 1496 aa26.26■■□□□ 1.79
TIMMDC1-205ENST00000486418 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.24■■□□□ 1.79
TIMMDC1-205ENST00000486418 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.24■■□□□ 1.79
TIMMDC1-205ENST00000486418 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.24■■□□□ 1.79
TIMMDC1-205ENST00000486418 ARHGEF11O15085 1522 aa26.18■■□□□ 1.78
TIMMDC1-205ENST00000486418 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.12■■□□□ 1.77
TIMMDC1-205ENST00000486418 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.09■■□□□ 1.77
TIMMDC1-205ENST00000486418 ADAMTS12P58397 1594 aa26.07■■□□□ 1.76
TIMMDC1-205ENST00000486418 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.07■■□□□ 1.76
TIMMDC1-205ENST00000486418 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.06■■□□□ 1.76
TIMMDC1-205ENST00000486418 GRIN2AQ12879 1464 aa26.05■■□□□ 1.76
TIMMDC1-205ENST00000486418 KIF27Q86VH2 1401 aa25.99■■□□□ 1.75
TIMMDC1-205ENST00000486418 ARAP1Q96P48 1450 aa25.94■■□□□ 1.74
TIMMDC1-205ENST00000486418 IGF1RP08069 1367 aa25.94■■□□□ 1.74
TIMMDC1-205ENST00000486418 NUP160Q12769 1436 aa25.93■■□□□ 1.74
TIMMDC1-205ENST00000486418 CEP170Q5SW79 1584 aa25.92■■□□□ 1.74
TIMMDC1-205ENST00000486418 CUL7Q14999 1698 aa25.85■■□□□ 1.73
TIMMDC1-205ENST00000486418 SHROOM2Q13796 1616 aa25.78■■□□□ 1.72
TIMMDC1-205ENST00000486418 JPH4Q96JJ6 628 aa25.78■■□□□ 1.72
TIMMDC1-205ENST00000486418 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.78■■□□□ 1.72
TIMMDC1-205ENST00000486418 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms