Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CALCOCO2Q13137 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALCOCO2Q13137 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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