Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC18A2Q05940 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC18A2Q05940 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms