Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
UBXN2AP68543 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBXN2AP68543 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBXN2AP68543 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms