Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RPS25P62851 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS25P62851 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS25P62851 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS25P62851 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS25P62851 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS25P62851 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS25P62851 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RPS25P62851 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS25P62851 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS25P62851 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS25P62851 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS25P62851 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS25P62851 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS25P62851 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPS25P62851 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPS25P62851 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPS25P62851 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS25P62851 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS25P62851 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS25P62851 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS25P62851 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS25P62851 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS25P62851 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS25P62851 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS25P62851 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS25P62851 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS25P62851 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS25P62851 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS25P62851 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPS25P62851 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPS25P62851 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS25P62851 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS25P62851 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS25P62851 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS25P62851 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS25P62851 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS25P62851 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS25P62851 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS25P62851 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPS25P62851 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS25P62851 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS25P62851 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPS25P62851 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms